Эмомали (Шарипович) Рахмон(ов) родился 5 октября 1952 года в городе Дангара (провинция Куляб) Таджикской ССР. С 1971 по 1974 год Рахмон служил в советских вооруженных силах. Его первая руководящая должность - директор совхоза в Дангаре.
С 1976 по 1988 год он работал секретарём правления колхоза Дангаринского района Кулябской области, председателем профкома этого хозяйства, а также занимал должность в партийных органах. В течении этого времени он учился на экономиста в Таджикском государственном университете и закончил его в 1982 году. В июне 1988 года Рахмонов стал директором совхоза им. Ленина Дангаринского района, занимая эту должность до ноября 1992 года.
В 1990 году он стал депутатом Верховного Совета Таджикской ССР, работая в парламенте во время больших политических потрясений. Рахмон Набиев был вынужден уйти с поста президента на ранних этапах гражданской войны в стране, которая началась в 1992 году. Спикер парламента Акбаршо Искандаров, который исполнял обязанности президента только в течение трех месяцев, также был вынужден уйти. Рахмон сменил Искандарова в качестве спикера, а затем стал главой правительства в 1992.
6 ноября 1994 года Рахмон был избран на вновь созданную должность президента. Первые годы его президентства были не менее сложными, чем у его предшественников. Гражданская война продолжалась, и только в июне 1997 года было достигнуто перемирие между правительством и Объединенной таджикской оппозиции. В результате конфликта погибли более 50 тысяч человек. Рахмон сам пережил покушения в апреле 1997 года и ноябре 2001 года, попытки государственного переворота в конце 1997 года.
Рахмон был избран на второй срок в качестве президента в ноябре 1999 года. В соответствии с конституционными изменениями срок президентсва был продлен до семи лет. В июне 2003 года прошел референдум, который дал возможность Рахмону управлять государством еще два срока подряд после его второго срока в 2006 году. 6 ноября 2006 года Рахмон был переизбран на третий срок на фоне широкой критики, которая заключалась в оценке выборов как несвободных и несправедливых. Если Рахмон будет переизбран в конце 2013 года, то его полномочия продляться до 2021 года.
22 марта 2007 года он убрал русское окончание фамилии "-ов" и официально стал именоваться как Рахмон.